國家文官學院前身係民國88年7月26日成立之「國家文官培訓所」，99年3月26日改制成立，並同時於南投縣中興新村成立「國家文官學院中區培訓中心」，又分別於107年11月19日及109年2月24日以任務編組成立「國家文官學院高雄園區（小港）」及「國家文官學院高雄園區（澄清湖）」。